市場與支持 News
腫瘤細胞轉移進入顱內結構和腦脊液是晚期黑色素瘤最嚴重的并發癥之一。多達5-7%的黑色素瘤患者會出現軟腦膜黑色素瘤轉移,這些患者的預后很差,通常平均存活8-10周。當前對于軟腦膜黑色素瘤轉移(Leptomeningeal Melanoma Metastases,LMM)患者的腦脊液(cerebrospinal fluid,CSF)環境幾乎一無所知,難以制定有效的治療策略。日前,國際專業學術期刊Clinical Cancer Research( IF=8.911)在線發表了美國佛羅里達州坦帕市莫菲特癌癥研究中心團隊的最新研究成果“Proteomic analysis of CSF from patients with leptomeningeal melanoma metastases identifies signatures associated with disease progression and therapeutic resistance”。 研究人員運用系統的蛋白質組學方法對來自軟腦膜黑色素瘤轉移(LMM)患者的腦脊液樣本進行了分析,研究首次發現LMM患者的腦脊液與沒有LMM的患者在生物學上是不同的。研究指出LMM微環境的了解將有助于開發能夠延緩疾病進展的新治療策略。此篇文章中,研究人員對來自黑素瘤軟腦膜轉移患者的腦脊液標本進行了分析。使用TMT標記蛋白質組學定量技術來...
發布時間: 2020 - 02 - 17
2019年諾貝爾生理學或醫學獎授予了在細胞感知和適應低氧(稱為hypoxia)領域取得突出貢獻的三位科學家。越來越多的研究顯示,低氧參與到包括腫瘤,感染,局部缺血和炎癥等疾病的發生發展中。圖片來源:諾獎官網低氧誘導因子1α(HIF1α)是應答低氧調控的關鍵轉錄因子,它在低氧條件下表達穩定并能入核調控下游基因的表達。除此之外,炎性因子和微生物感染能激活免疫細胞并誘導糖酵解發生,同時也會活化HIF1α[1]。已有的研究表明,在巨噬細胞和樹突狀細胞的炎癥激活過程中,HIF1α和糖酵解途徑的代謝物能夠促進炎癥。同時,低氧和炎癥激活伴隨的糖酵解通路活化能夠增加乳酸的產生和釋放并促進細胞外環境的酸化,而高濃度的乳酸可以轉運到細胞內作為底物被代謝。細胞感知和適應氧氣變化機制示意圖之前的研究表明,乳酸會增加T helper 1細胞的分化和干擾素γ(IFNγ)的產生[2]并促進腫瘤相關巨噬細胞(TAMs)的M2樣極化以及VEGF表達[3],因此有研究者提出假設,乳酸是否可能通過多種機制抵消HIF1α和糖酵解代謝產物所帶來的炎癥反應進而促進細胞穩態?令人興奮的是,關于該假設的研究近些年來取得了突破性的進展。2019年12月9日,免疫學領域專業期刊Nature Reviews Immunology 以“Year in Review”系列專題形式,發表題為The hypoxia–lactate ...
發布時間: 2020 - 02 - 14
O-糖基化修飾(O-GIcNAc)是一種動態可逆的、普遍存在的蛋白質翻譯后修飾,廣泛參與到諸如轉錄調控、細胞代謝、信號轉導、蛋白降解等生物進程。糖基化蛋白通常位于細胞表面且容易分泌到循環系統中,具有作為疾病診斷生物標志物的巨大潛力。近日,來自國家蛋白質科學中心( 北京)、中國軍事科學院軍事醫學研究院生命組學研究所錢小紅團隊、秦偉捷團隊合作,發表了一種新的集成數據處理策略,基于參考庫的MS1特征匹配和MS2識別傳播,可快速識別、高深度和可重現的無標記的人類尿液O-糖基化定量蛋白質。這種策略將數據庫搜索速度提高了20倍,并使單個樣品中完整O-糖肽定量提高了30%-40%,重現性明顯提高。運用該集成數據處理策略,作者共在36個健康的人類尿液樣本中鑒定出1300個完整的O-糖肽,缺失數據量減少了30%-40%。這是目前尿O-糖蛋白組學的最大數據集,證明了這種新策略在大規模臨床研究中的應用潛力。相關研究成果發表在專業學術期刊Analytical Chemistry上。尿液樣本糖基化組學分析流程圖糖基化作為最復雜的蛋白質翻譯后修飾之一,蛋白質組中絲氨酸和蘇氨酸殘基的廣泛存在,以及數十種不同的O-聚糖類型,導致糖基化的數據庫搜索需要非常長的時間。搜索典型的尿液O-糖蛋白組的原始MS文件包含120多個MS2譜圖,需要花費120多個小時,即使將O-糖肽譜圖整理出來,仍需要60個小時。除此之外,由于完...
發布時間: 2020 - 02 - 13
眾所周知,已知長期高鹽飲食會增加患高血壓的風險,進而發展導致心血管疾病和慢性腎臟疾病。高血壓與腎病存在密切聯系,一方面,腎臟實質性病變和腎動脈病變導致血壓升高,這種關聯性疾病在繼發性高血壓中稱為腎性高血壓(renal hypertension)。另一方面,慢性腎臟疾病有三分之一由高血壓導致,長期高血壓將造成腎臟不可逆轉的器質性損害,導致尿中蛋白質增加,從而引發高血壓腎病(hypertensive renal disease)。不管是患有腎病還是患有高血壓都會有可能誘發另一種疾病的出現,但人們對其中的具體機制知之甚少。近日,在國際專業學術期刊Science Signaling上發表了一篇采用整合蛋白質組學聯合分析的手段研究高血壓-腎病轉換的文章,德國科隆大學的Gary Siuzdak課題組對高鹽飲食誘導的高血壓模型大鼠腎臟組織進行蛋白質組學、磷酸化修飾組學和代謝組學分析,揭示了高血壓引起腎小球硬化的代謝變化,包括在疾病早期階段的脂質分解和激活貧血通路,提示通過飲食干預代謝能夠有效防治高血壓引起的腎臟疾病。研究速讀1. DDS大鼠模型與非靶向代謝組學分析研究人員首先建立了一個具有高血壓和蛋白尿特征的大鼠模型(Dahl salt-sensitive,DSS)。首先,研究者使DSS大鼠日常攝入4%的過量鹽分,7天后僅觀察到血壓升,隨后至21天血壓持續上升并伴有腎損傷。對高鹽飲食早期(7天)...
發布時間: 2020 - 02 - 13
線粒體肌病(mitochondrial Myopathy)是一種少見的,由于線粒體結構和(或)功能異常所導致的以肌肉受累為主的多系統疾病病。線粒體肌病以呼吸鏈的裝配和功能缺陷為特征,線粒體DNA和細胞核DNA(nDNA)的突變是這些疾病的主要原因。雖然測序擴大了線粒體肌病的診斷范圍,大大提高了線粒體肌病的診斷水平,但其潛在的病理生理機制仍知之甚少。2019年12月17日,國際知名期刊Cell Reports在線發表了馬克斯普朗克生物化學研究所所長Matthias Mann團隊與慕尼黑大學神經學系Thomas Klopstock團隊的最新合作研究成果“Proteomics of Cytochrome c Oxidase-Negative versus -Positive Muscle Fiber Sections in Mitochondrial Myopathy”。研究人員運用基于質譜的蛋白質組學技術結合激光捕獲顯微解切割技術,對分離出的肌纖維進行蛋白質組學分析,系統揭示了線粒體肌病的病理機制。此篇文章中,研究人員運用激光捕獲顯微解切割技術捕獲線粒體肌病活檢個體(COX+和COX-)的肌纖維,結合蛋白質組學技術研究了線粒體肌病如何改變肌纖維蛋白組,以及不同的纖維類型如何應對受損的呼吸鏈活動,揭示了肌纖維在應對能量短缺和代謝壓力時的代償機制。1蛋白質組學工作流程研究人員使用最近描述的...
發布時間: 2020 - 02 - 07
1 月 9 號,國際專業學術期刊 Cell Metabolism(IF =22.415 )發表了題為Comprehensive Proteomics Analysis of Stressed Human Islets Identifies GDF15 as a Target for Type 1 Diabetes Intervention研究論文[1],西北太平洋國家實驗室的 Thomas O. Metz 課題組運用蛋白質組學分析從人類胰島中發現了 GDF15 對一型糖尿病的影響,GDF15為1型糖尿病干預的靶標。生長分化因子-15(Growth/differentiation factor 15,GDF15)是轉化生長因子-β 超家族(TGFβ super family)的一員。此前 GDF15 被發現在創傷過后的多種器官出現明顯的上調,被認為是不少疾病的標記物。2017 年前后,醫學界進一步發現了它在肥胖治療的潛力,獲得了科學家的廣泛關注[2]。一型糖尿病(T1D)是由β細胞加工性喪失引起的,該過程是由促炎性細胞因子信號傳導傳播的,破壞了促凋亡和抗凋亡蛋白之間的平衡。為了鑒定參與該過程的蛋白質,研究人員運用TMT蛋白質組定量技術(質譜策略),對用白介素-1β和干擾素-γ處理的人胰島(樣品策略)進行了全面的蛋白質組學研究,從中鑒定出11,324種蛋白質,經過處...
發布時間: 2020 - 02 - 06
新型高致病性冠狀病毒(2019-nCoV)在中國的出現及其在國內和國際的迅速傳播構成了全球衛生緊急情況。全國范圍內各省陸續啟動重大突發公共衛生事件一級響應,14億人民眾志成城,奮斗在這場看不見硝煙的戰爭之中。值得注意的是,技術的進步為疫情的防控提供了寶貴的時間和指導意義。1月10日,新型冠狀病毒的基因組被破譯。隨后不久,2019-nCoV核酸檢測試劑盒研制成功,應用于一線疫情防控。一項項科研成果的陸續取得,為我們奠定了堅決打贏疫情防控阻擊戰的信心。作為一種未知的新型病毒,2019 nCoV仍有諸多問題需要深入解決,并藉此開發更有效的治療和預防手段。近年來,Nature、Cell等高水平學術期刊報道了科學家運用蛋白質組學技術開展的病毒學、致病病理學研究成果,對于此次肺炎疫情的進一步研究具有一定參考意義。病原體入侵包括幾個基本的步驟:1,病原體和宿主細胞相互識別,通過內吞或者膜融合等方式進入到宿主細胞內;2,病原體與宿主細胞發生一系列的相互作用,病原體能夠干擾宿主細胞的免疫系統、劫持宿主細胞的部分原件為病原體利用;3,實現病原體本身的復制、增殖和釋放。病原體入侵的基本的步驟從這個角度出發,蛋白質組學技術可用于以下研究:(1)發現新的互作蛋白復合體;(2)解析病毒侵染前后宿主和病原體蛋白的表達和翻譯后修飾變化;(3)解析侵染過程中的蛋白質動態時空分布變化。1.Nature:蛋白質組學揭示...
發布時間: 2020 - 02 - 03
不久前我們回顧了2019年度蛋白質組學領域的精選研究,在過去的一年里,數十篇蛋白質組學相關的研究應用見刊于CNS等頂級期刊,為生命科學與精準醫學領域增添了濃墨重彩的一筆(詳情請點擊:碩果累累,2019年蛋白質組學精華研究盤點)。更加讓人振奮的是,過去的幾年,隨著我國科研人員的不懈努力,再加上國家對蛋白質組學研究的穩步支持,中國蛋白質組學研究實現了跨越式的發展,高水平的研究論文層出不窮。今天,編者精選了2019年度,國內外華人學者在Cell、Science、Nature發表的蛋白質組與蛋白質修飾組學研究成果,以饗讀者。排序按照發表時間,不分先后。中國人類蛋白質組計劃發現肝癌精準治療新靶點:Proteomics identifies therapeutic targets of early-stage hepatocellular carcinoma2019年2月28日,Nature在線發表了軍事科學院軍事醫學研究院生命組學研究所、國家蛋白質科學中心(北京)、蛋白質組學國家重點實驗室賀福初院士團隊、錢小紅教授團隊聯合復旦大學附屬中山醫院樊嘉院士團隊等開展的早期肝細胞癌蛋白質組研究成果。研究首次描繪了早期肝細胞癌的蛋白質組表達譜和磷酸化蛋白質組圖譜,發現了肝癌精準治療的新靶點。點擊圖片查看詳細解讀研究人員運用蛋白質組學和磷酸化組學等技術,針對110個與乙型肝炎病毒感染相關的臨床早期肝細胞...
發布時間: 2020 - 01 - 18
“蛋白組學·2019”線上文獻閱讀大賽開賽以來,陸續收到了很多參賽作品。經過評審團隊精心的審閱、篩選,優秀參賽作品將陸續在“精準醫學與蛋白組學”學術平臺發布。此次活動由蛋白組學、修飾組學的領軍企業——景杰生物獨家支持,更多精彩活動,期待你的參與~~~參賽者:金梓婧 (上海交通大學基礎醫學院)參賽作品:全身性幼年特發性關節炎不同炎癥表型的分子特征文章名稱:Molecular signature characterisation of different inflammatory phenotypes of systemic juvenile idiopathic arthritis發表期刊:Ann Rheum Dis(IF=14.299)發表日期:2019年4月全身性幼年特發性關節炎(Systemic juvenile idiopathic arthritis, SJIA)是一種不明機制的自發炎癥疾病,占幼年特發性關節炎(JIA)的10%-15%。國際類風濕學協會聯盟對SJIA的判定標準是連續2周發熱、短暫的皮疹以及慢性關節炎。然而在SJIA的早期,關節炎的癥狀表現得很少,甚至不存在。而其他的疾病,比如由感染引起的一些疾病,與SJIA有著相似的癥狀,這就使得SJIA的早期診斷難度大幅度增加。眾所周知,早期的診斷是開展有效靶向治療的重要方法,所以找到能夠確診早期SJ...
發布時間: 2020 - 01 - 15
光陰似箭,歲月如梭,2019年的歲月轉瞬即逝, 2020新年鐘聲已然叩響了新新一年的大門。在過去的2019年里,蛋白質組學,尤其是修飾組學研究蓬勃發展,劈波斬浪,接連取得重大突破,數十篇相關的研究應用見刊于CNS等頂級期刊,為生命科學與精準醫學領域增添了濃墨重彩的一筆。在此,我們匯總了蛋白質組學、與翻譯后修飾領域在2019年的精華研究。一起來看一下2019年中,蛋白質組學都取得了哪些重要突破?2019.02中國人類蛋白質組計劃發現肝癌精準治療新靶點doi:10.1038/s41586-019-0987-82019年2月28日,Nature在線發表了軍事科學院軍事醫學研究院生命組學研究所、國家蛋白質科學中心(北京)、蛋白質組學國家重點實驗室賀福初院士團隊、錢小紅教授團隊聯合復旦大學附屬中山醫院樊嘉院士團隊等開展的早期肝細胞癌蛋白質組研究成果。研究首次描繪了早期肝細胞癌的蛋白質組表達譜和磷酸化蛋白質組圖譜,發現了肝癌精準治療的新靶點。腸道微生物通過亞硝基化修飾影響宿主doi:10.1016/j.cell.2019.01.037通過代謝物擴散并影響蛋白質的修飾和功能,是腸道微生物群落對宿主發揮調控作用的重要機制。2019年2月21日,凱斯西儲大學醫學院和克利夫蘭醫學中心的Jonathan S. Stamler研究團隊在Cell發文,運用亞硝基化修飾組學,發現腸道微生物產生的一氧化氮(NO...
發布時間: 2020 - 01 - 13
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